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近年来，北京地区各医院纷纷自行发就诊卡，这在一定程度上方便了病人到该院就诊，但另一方面，由于卡片不统一，病人手中就会持有多张不同医院的卡片。市卫生局在2009年做的一项调查发现，73.1%的公众对一院一卡造成就诊不便表示不满意，希望尽快统一就诊卡。在近几年的人大会、政协会上，人大、政协代表对统一医院就诊卡的建议和提案也是比较多，呼声很高。
此外，目前卫生突发事件层出不穷，由于没有统一的病人身份识别，无法在全市医院门、急诊全面、完整、准确地采集所有患者的基本信息和疾病症状信息，因而无法进行有效的监测和预警。而市人力资源与社会保障局所发社保卡也仅针对本市医保病人，其他外地来京病人、农合病人等约占北京大医院就医人群40%以上，却不包括在内，影响有效监测和预警。
卫生部等五部委联合发布《关于公立医院改革试点的指导意见》重点任务中提到，要提高医院信息化水平，而《北京市2010—2011年深化医药卫生体制改革实施方案》在重点任务中也将推进医药卫生信息化建设写入其中，要求加强信息化标准建设，统一规范医院信息系统数据接口和信息采集，逐步推进公共卫生、医疗、医保、药品、财务监管等信息系统互联互通。
在此背景下，市卫生局与市财政局、市人力资源与社会保障局以及市经济和信息化委员会进行充分沟通后，达成一致意见，对不同医院的就诊患者统一身份标识，进行患者索引是区域化卫生行政管理的基础和必备条件。为此，2010年初市卫生局启动统一条码号，采集门急诊相关信息，方便病人就诊的"医联码"项目，采用"医联码"与各医院就诊卡关联的方式统一病人就诊号，采集门急诊相关信息。“医联码”的发放对象是非医保病人，医保病人的信息采集采用社保卡，“医联码”和社保卡共同组成所有就诊患者的身份标识，并在适当的情况下逐步规范各医院的就诊卡。
项目启动后，首先选取了首都医科大学附属北京天坛医院、北京妇产医院以及北京大学第三医院三家医院作为试点，进行了医院信息系统接口改造以及联调等工作，目前，在这些试点单位的大力支持下该项目已取得了较大进展，各试点医院已基本完成“医联码”技术部分的系统接口改造和调试工作，正在进行“医联码”的试发放工作。由于“医联码”就是统一编号的一维条码，成本低，各医院在通过社保卡实时结算之前，和医保对接通过医保手册，都采购了足够数量的条码扫描枪，来读取医保手册的条码，这次推行“医联码”读码设备不需要再采购。北京市卫生局组织“医联码”工作部署会，计划9月份，在所有三级医院和十一家区县中心医院，针对非医保病人发放“医联码”。
项目建成后，首先可更好地方便患者就医；其次，方便医院管理。在院内用唯一身份识别的条码号进行就医、划价、检查、取结果、取药，通过信息化管理手段，减少医疗差错；第三，方便政府管理。通过统一就诊号采集门急诊信息，可以很好地了解医疗需求，了解疾病谱变化，科学合理地配置资源。同时，可支持突发事件的应对以及传染病症状监测。
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