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青海玉树强烈地震，使灾区畜牧业生产受到严重损失，大量牲畜因灾死亡，乡镇兽医站大面积倒塌。为尽快恢复地震灾区基层动物疫病防控能力，“确保大灾之后无大疫”，促进灾后畜牧生产恢复发展，4月15日农业部紧急制定《青海玉树抗震救灾动物防疫工作实施方案》，全面部署抗震救灾防疫工作。方案以确保地震灾区不发生重大动物疫病和重要人畜共患病，保障灾区畜牧业发展恢复，维护灾区公共卫生安全为目标，重点部署了五项工作。
一是强化死亡畜禽无害化处理和环境消毒工作。当务之急是制定科学的死亡畜禽无害化处理方案，选择合适的尸体处理地点和方法，尽快进行无害化处理。对死亡畜禽所在地、存活畜禽圈舍及周边地区进行消毒，消灭病原微生物，不留死角。
二是强化重大动物疫病和重要人畜共患病防控工作。玉树州位于中亚候鸟迁徙带，目前正值候鸟北迁季节，传播禽流感疫情风险很大。要求有关单位加强疫情监测，坚决防止候鸟禽流感病毒传染家禽，并感染人。根据灾区畜禽养殖及人畜共患病流行情况，尽快对存栏牛进行一次炭疽紧急免疫。加强灭鼠工作，防止出现鼠疫暴发流行。
三是强化动物及动物产品检疫监管工作。鉴于目前大量畜产品调往灾区，组织周边地区兽医部门，建立快速检疫通道，加强调往灾区畜产品安全监管，增派人员，加强值班力量，确保产品安全，确保运输畅通。对因灾死亡畜禽，严格落实“四不准一处理”措施，即“不准宰杀、不准食用、不准销售、不准转运，必须进行无害化处理”。
四是做好突发重大动物疫情应急准备工作。农业部重大动物疫情应急预备队做好准备，所有队员保持通讯畅通，随时待命出发。
五是开展重大动物疫情发生风险评估工作。及时统计畜牧兽医行业受灾情况，掌握畜禽死亡数量，畜牧兽医基层机构受损等情况。根据灾情，结合当地重大动物疫病和人畜共患病流行病史，分析评估疫情发生风险，采取进一步防控措施。
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