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科技部重大专项办提供媒体的《国家科技重大专项2009年度报告》显示，重组痘苗病毒(rTV)艾滋病疫苗的Ⅰ期分为Ⅰa、Ⅰb两个阶段进行。Ⅰa期结果表明：受试者均出现了预期的疫苗接种反应，对rTV疫苗可良好耐受，未观察到严重副反应;Ⅰb期完成了全部受试和临床访视，无严重不良事件，安全性好。其Ⅱ期临床试验所需的疫苗已经完成生产，正在进行安全性评价，预计在2010年下半年开展Ⅱ期临床试验研究。据知，rTV疫苗是当前国际上唯一进展到临床试验阶段的复制型载体HIV疫苗。
同时，第二代DNA疫苗、粘膜疫苗、痘苗载体和新型疫苗抗原的设计和改造的创新性工作已顺利开展，使中国第二代HIV疫苗具备了更强的技术优势和竞争力，为下一阶段的临床试验研究做好了人才队伍和技术储备。
此外，依托“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”专项及其他的国家科技计划，4个艾滋病疫苗团队及2个技术平台负责人自发组织，联合全国50多家科研院所、重点院校、疫苗生产单位成立了中国艾滋病疫苗联盟(CAVI)，有效促进中国艾滋病疫苗领域的交流与合作，共享资源、互通信息，横向联合开展技术攻关。
“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”专项的新型乙型肝炎治疗性疫苗，在已完成的243例乙肝患者的Ⅱ期临床中显示出较为满意的疗效，在重大专项支持下，Ⅲ期临床试验已完成517例乙肝患者的招募，其中400例患者完成了疫苗的治疗，预计2010年底完成该疫苗的注册临床试验。
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